一、性质不同
1、着丝粒：着丝粒是连接一对姐妹染色单体的特化DNA序列。
2、着丝点：着丝粒两侧各有一个蛋白质构芤晟踔肿成的盘状或球状结构称为着丝点。
二、作用不同
1、着丝粒：着丝粒主要被视为引导染色体行为的基因座；物理功能上，着丝粒为动粒组装提供了位点。
2、着丝点：着丝点(Kinetochore)是细胞分裂的重要细胞器，是细胞纺锤体微管附着的地方。
三、作用过程不同
1、着丝粒：着丝粒（染色体的主缢痕primaryconstriction）为染色质的结构，将染色体分成二臂，在细胞分裂前期和中期，把两个姐妹染色单体连在一起，到后期两个染色单体的着丝粒分开。
2、着丝点：着丝点与染色体的移动有关，在细胞分裂（包括有丝分裂和减数分裂）的前、中、后期，纺锤体的纺锤丝（或星射线）微管就附着在着丝点上，并牵引染色体移动。
