1、干燥综合症遗传基础：在对免疫遗传的研究测定中，医学家发现人类白细胞抗原中，hla-dr3、b8与干燥综合症密切相关，且这种相关又因种族的不同而不同，如西欧人与hla-b8、dr3、dw52相关，日本人与hla-dr53相关，这说明干燥综合症有遗传倾向。
2、免疫因素： 包括体液免疫与细胞免疫异常。过度的体液免疫，可导致血液中出现多种器官特异性和非特异性抗体，如抗涎腺导管上皮抗体、抗ssa、抗 ssb、抗核抗体、抗dna抗体等。细胞免疫异常有植物血凝素淋巴细胞转化率低下和自然杀伤细胞活性下降等，但最重要的是t淋巴细胞亚群的变化，即抑制性t细胞减少。
3、干燥综合症病毒感染。目前至少有三种病毒如eb病毒、巨细胞病毒、hiv病毒被认为与干燥综合症有关，eb病毒能刺激b细胞增生及产生免疫球蛋白。有医学家在原发性干燥综合症患者中的涎腺、泪腺、肾脏标本中检测出eb病毒及其dna基因。
