1、花不同
裸子植物，有孢子叶球，而无真正的花。
被子植物，具有真正的花，被子植物在形态上具有不同于裸子植物所具有的孢子叶球的花。
2、形态不同
裸子植物：种子裸露，没有皮包裹，裸子植物它们有胚珠（不同于蕨类植物门），但心皮不包成子房，且胚珠裸露，胚乳（即雌性原叶体）在受精前已形成（不同于被子植物门）。
被子植物：被子植物种子是由果皮包裹着的。
3、种子胚数不同
被子植物种子内通常只有一个胚。
裸子植物大多数种子内有强烈的多胚现象。
扩展资料
裸子植物广布于南北半球，尤以北半球更为广泛，从低海拔至高海拔、从低纬度至高纬度几乎都有分布。裸子植物的科、属、种数虽远比被子植物少，但覆盖面积却大致相等。
在高纬度及高海拔气候温凉至寒冷的地区，几乎都是某些裸子植物形成的单纯林或组成的混交林。
