1、疾病：主要包括消耗性疾病，如重度肺结核、严重贫血、营养不良等，特有的内分泌疾病，如"肥胖生殖无能性营养不良病"等；体内一些内分泌系乱的影响，如肾上腺、甲关腺、胰腺等功能紊乱。这些原因的影响，都可能不来月经。
2、生殖道下段闭锁：如子宫颈、阴道、处女膜、阴唇等处，有一部分先天性闭锁，或后天损伤造成粘连性闭锁，虽然有月经，但经血不能外流。这种情况称为隐性或假性闭经。
3、脑垂体不正常：脑垂体能分泌促性腺激素。促性腺激素有调节卵巢功能和维持月经的作用。如果脑垂体的功能失调，就会影响促性腺激素的分泌，进面影响卵巢的功能，卵巢功能不正常就会引起闭经。
4、丘脑功能不正常：下丘脑功能不正常也会引起闭经。引起下丘脑功能失调的原因很多，如精神刺激、悲伤忧虑、恐惧不安、紧张劳累，以及环境改变、寒冷刺激等。
5、生殖器官不健全或发育不良：有的人先天性无卵巢，或卵巢以育不良，或蚤鹋涸钏卵巢颀坏，不能产生雌激素和孕激素，因此子宫内膜不能发生周期性的变化，也就不会出现子宫内膜脱落，所以也就没有月经来潮。
6、结核性子宫内膜炎：这是由于结核菌侵入子宫内膜，使子宫内膜发炎，并受到不同程度的破坏，最后出现瘢痕组织，而造成闭经。
