1、个体工商户在增值税征收方式上与公司制企业没有区别。按规模大小分小规模纳税人和一般纳税人，按各自的计算方式缴纳增值税。
小规模纳税人按季计算，销售额在30万元以内免征增值税。相应的附加税为零。
2、个体工商户小规模纳税还没有取消核定征收，一般情况下分三类行业核定 ：
1.商业企业：0.4%
2.工业企业：0.7%
3.其他企业：0.12%
3、个体工商户一般纳人取消核定征收，按生产经营所得缴纳个人所得税。与公司制企业不同，已包含了利润分红个税。
个体工商户的生产、经营所得，以每一纳税年度的收入总额，减除成本、费用、税金、损失、其他支出以及允 许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。
4、个体工商户下列支出不得扣除：
① 个人所得税税款；
② 税收滞纳金；
③ 罚金、罚款和被没收财物的损失；
④ 不符合扣除规定的捐赠支出；
⑤ 赞助支出；
⑥ 用于个人和家庭的支出；
⑦ 与取得生产经营收入无关的其他支出。
