1、瘘管、瘘口的增加：肛瘘多次的发作就会导致瘘管和瘘口的增加，这样就会给治疗增加了难度不说，还会影响正常的肛门功能和给患者带去很大的痛苦。
2、感染、流脓：肛瘘的主要症状就是流脓，流出的脓液是会刺激肛门的皮肤出现瘙痒和潮湿的情况。同时这样也是很容易滋生细菌。这样就会导致其它疾病。
3、肛门失禁：如果对于肛瘘久拖不治，就会给肛门括约肌带去很大的伤害这样就会出现肛门失禁的并发症，是会严重的影响正常的生活的。
4、癌变风险：肛瘘是有着多变性的，在肛瘘久拖不治就会形成复杂性肛瘘的，这样就会污染到其它的器官就会有癌变的风险。
