1、试剂配制和贮存区：本区的功能是实验相关试剂（如核酸提取液、乙醇等）的配制和贮存（包括商业化的试剂，如PCR反应缓冲液、Taq酶和 dNTPs等）。用于PCR扩增的试剂建议分装后保存。
2、样品制备区：本区的功能为待检样品的保存、核酸的提取、贮存等。进行RNA检测的实验室在此区域内应辟出专门的RNA操作区，或安装一台Ⅱ级生物安全柜或外排风式的排风橱来替代。
3、PCR反应配制区：本区的功能为配制、分装PCR主反应混和液以及加入核酸模板。对于使用巢式PCR进行检测的实验室，SICOLAB建议在此区内安装一台Ⅱ级生物安全柜或外排风式的排风橱，第一轮的扩增产物添加至第二轮的主反应混和液的操作可在此区进行。
4、扩增区：核酸扩增。加了DNA或RNA等模板的反应管应盖好管盖后才拿到本区。
5、扩增产物分析区：本区的功能为扩增片段的测定。本区是最主要的扩增产物污染来源，应注意避免通过本区的物品将扩增产物带出。对于使用定量PCR进行检测的实验室，此产物分析区可以省略。
