1、排便不通畅：复杂性的肛瘘经常久治不愈，也很有可能导致直肠的周围造成很大的纤维化或者破话，影响着人们的正常生活，大便时也会感到困难，有种感觉就是便意不尽。
2、肛门瘙痒：患上了痔疮，分泌物会明显的增多，并不断刺激肛周皮肤产生湿疹，所以患者常感觉瘙痒，肛周潮湿不适，皮肤变色、表皮脱落，纤维组织增生和增厚。
3、引发肛肠疾病：痔疮还可以引发多种肛肠疾病，比如肛裂、肛瘘等。当这些疾病共同存在于患者身上时，这会给治疗带来非常大的难度，恢复时间也会加长，最影响工作和学习。
4、流脓：脓液的多少与瘘管的长短有些联系，而且新生的肛瘘的流脓也是相对较多，分泌物会对皮肤的瘙痒感到不适。瘘管的脓液会积存造成肿胀发热，然后会导致瘘口的破溃，只有当瘘口破溃的时候症状才会消失。
