1、雄海马的尾部腹面有一育儿囊（位于肛门后端）<br>该囊是当第一次生殖来临时，由尾部腹面左右伸出的皮招接合而成，只留未端小孔。
2、雌鱼的泄殖腔未端在产卵期中也多少膨大，形成生殖乳突。此外，雄海马的个体一般比雌鱼稍大些。斑海马体长一般为10-17厘米。体侧扁，头部似马头，腹部明显突出。躯干呈七棱形，尾部呈四棱形，尾较长渐细并向腹面卷曲，用以卷住海藻等作栖息用。
3、吻细长，呈管状，口甚小，位于近头侧背方。头与驱干部成直角。海马全身无鳞片，完全由骨环所包被。鱼体一般呈褐色，但随栖息环境的变化，体色可随之发生变化并与环境趋于一致。
4、体侧第1、4、7体环的背方各有一黑色圆斑，故称三斑海马，这是分辨本种的主要特征。雄鱼尾部腹面具有1个特殊的袋状器官。
