1、首先，环保立案之后会展开一系列的调查程序，这里其中包括询问当事人，现场勘查、检验鉴定什么的。除和当事人作调查材料之外，其他的工作基本上都是由专业人员来做。当事人在接受询问的时候，要根据权利告知书上的内容，维护自己的权力，具体的内容调查人会在谈话前出示，自己仔细阅读就可以了。
3、再次，有些时候，环保立案之后，会对相关的场所或者其他证据进行登记保存，或者查封、暂扣，在这个时候当事人应当注意，一是物品的数量，二是处置的时间，比如说作登记保存的，过了7天之后就自动解除了。
5、第五，撤销案件。环保立案调查之后，发现当事人并没有违法，那么他们也会把这个案件撤销掉。这也要开具文书，工作人员也会通知当事人。这里也要注意，案件撤销了，以前扣押、查封的物品有的也应当退还。
