microRNA二代测序分析流程

 时间:2024-10-16 10:23:04

1、背景:microRNA是一类大小为21-23nt的非编码小RNA分子,其通过与mRNA相互作用影响目标mRNA的稳定性及翻轿杷傥桓译,最终诱导基因沉默,调控基因表达,细胞生长,发育等生物过程。基于第二代测序技术的microRNA测序,可以快速鉴定出已知的microRNA,也可以预测出新的可能microRNA,并分析其差异,为研究microRNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具。这里我们对microRNA二代测序结果的分析处理进行简析,下图能够很清晰地说明microRNA二代测序结果的处理步骤。

2、microRNA长度分布统计以验证试验可靠性:应用fastx (fastx_toolkit)对测序原始reads进行预处理,去除接头序列以及低质量序列。

3、microRNA 质量分析结果

microRNA二代测序分析流程

8、microRNA在正常发育过旯皱镢涛程以及疾病发生过程中具有重要的作用,在诊断和治疗领域具有光明的应用前景。基于高通量测序平台的microRNA测序技术突破了之前研究手段的局限性,不但可以检测到microRNA表达差异,而且可以研究microRNA的3’异质性,以及未发现的新的microRNA,为更加灵活、深入研究microRNA提供解决方案。上海丰核拥有强大的生物信息学团队,能够根据不同客户的要求进行深入和标准的数据分析服务,提供能够直接应用于文章发表的数据和图表。有关更多的详细信息可以查询其官方网站。

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