1、第一，稳定性强。复合碘为碘与特殊表面活性剂在酸性环境下形成络合物，在提高碘含量的同时，也增强了碘的稳定性。
2、第二，广谱、强效。能迅速杀灭各种细菌及其繁殖体、芽孢、病毒、真菌等病原微生物，在防治鱼、虾、蟹、贝等的病毒、细菌性疾病上有非常好的效果，对水霉病、鳃霉病也有一定的防治作用。
3、第三，起效快。复合碘是目前含碘消毒剂中药效表现最为明显的一种水体杀菌消毒制剂，在水体消毒与防治鱼类出血、烂鳃、肠炎、溃疡等疾病方面都比较迅速、彻底。由于其碘含量较高，同时又配伍了高效表面活性剂，增强了其渗透力，所以起效迅速、病症消失快。
4、第四，药性温和，刺激性小。由于其较强的稳定性，在水体中有效因子缓慢释放，所以它的药性较温和，对鱼的刺激性相对较小，泼洒该药后，鱼体表面和鱼的生理活动无明显的变化和不良反应，也不会引起鱼类的厌食反应。既避免引起鱼类继发性鱼病的发生，又达到了水体消毒、防病治病的目的。
5、第五，用量小。由于复合碘中的碘含量高，同时又复配有增效剂，其用量非常小，每亩水体水深1米时，用量仅66.7ml。因此，它尤其适合水库、湖泊等大型养殖水体的使用。
6、第六，受环境影响小，药效不受有机物的影响。菌毒消中的表面活性剂具有很强的水体清洁作用，彻底改变了普通碘制剂有机物抗性差的缺点。因此在有机物和低温环境中也能发挥非常好的消毒效果。
