不一定，不是所有的民办院校都是三本院校。
民办大学属于办学性质，三本属于录取批次，这两个是不同的概念，民办本科院校经过国家评核通过也可升级为二本院校。
大部分民本本科院校录取批次属于第三批，但也有个别发展比较好的民办本科院校具备录取第二批的考生资格，甚至成立博士办学点，例如西湖大学。
三本一般指普通高等学校招生全国统一考试招生录取批次中的本科三批。
截至2019年06月，已有北京、上海、天津、河北、浙江、甘肃、江苏、山东、福建、四川、山西、陕西、广西、湖北、江西、辽宁、广东、内蒙、重庆、贵州、河南、安徽、云南、西藏、新疆、宁夏、吉林，27个省（市、区）取消第三批次本科。
其中天津分二批AB段、山西分二批A/B/C段，其余省份待定。改革已经取得重要的积极成效，取消批次对减轻基础教育焦虑负担和高考焦虑具有重要深远的意义。
同时，上海、福建、山东、海南、浙江、北京、辽宁、河北将本科一批、本科二批合并；江西、湖南也于2018年取消二本批次，本科招生不再划分高考录取批次，促进教育公平公正，就业公平公正。
