合肥南站距合肥火车站14.9公里，乘车全程约1小时20分钟。
合肥南站到合肥火车站部分公交路线：509路→114路全程约1小时20分钟；509路→163路全程约1小时20分钟；快速公交1号线白班→163路全程约1小时30分钟。
空铁快线
2017年7月，合肥首条空铁快线开通，合肥高铁南站空铁快线运行时间为7：00至21：00，半小时一班车，7点，高铁南站候车厅发出首班车，末班车为21点；合肥新桥机场高铁快线运行时间为8：30至20：30，半小时一班。高铁快线班车从合肥高铁南站发车，通过合肥绕城高速经合六叶高速到达机场，最快仅需30分钟。
机场巴士3号线（汽车客运南站6：50~20：50，新桥国际机场8：30~19：00，7：00起，3号线由合肥南站始发，全程高速，平均约30分钟一班车）：汽车客运南站-合肥南站-新桥国际机场；新桥国际机场-合肥南站西落客平台-汽车客运南站。
