1、天猫旗舰店是商家以自有品牌（商标为R）入驻天猫开设的店铺，是独占授权书，也就是说一个品牌在天猫上只能开设一个旗舰店。天猫旗舰店的一般是商家自己注册的品牌，可以参与天猫大部分的营销活动，这也是大多数商家的选择。而旗舰店又分为只经营一个自有品牌、经营多个自有品牌且只有一个控制的品牌和卖场型旗舰店这三种类型。
2、天猫专卖店是商家通过代理的形式持品牌普通授权文件在天猫开设的店铺，称为“品牌专卖店”。一个品牌在天猫上可以开多个专卖店，只要开店公司不一样就可以。通常分为：经营一个授权品牌的专卖店、经营多个授权品牌且归于一个控制的专卖店这几种形式。
3、天猫专营店是指同一天猫经营大类下经营两个及以上品牌的店铺，可以授权一个类目的多个品牌，即商家开设天猫专营店可代理多个品牌的天猫店铺。一般情况下，也分为：经营两个及以上他人品牌的店铺、既经营他人品牌同时也经营自有品牌的店铺、经营两个及以上自有品牌的店铺这三种类型。
4、简单的来说，天猫旗舰店是品牌所有者或公司开的天猫店，天猫专卖店是只能经营一个品牌的一级授权商、代理商或者分销商。
