1、１、选育和利用抗病品种：番茄的不同品种对疫病的抗病能力有很大差别。一部分品种属于垂直抗病性的，另一种是属于水平抗病性的。番茄疫病菌容易发生变异，垂直抗病性品罩脾青槊种栽植几年后容易丧失其抗病性，应选育具有水平抗病性品种为重点。国内目前具抗病性能好的品种如黑龙江的克新１－３号、克疫，内蒙古的乌盟６０，河北的虎头、跃进、康华１号、３号、８号、陕西的文胜２号、３号，青海的青海３号以及从国外引入的德友１号、波友１号等都是高度抗病的品种。此外，内蒙古２号、里外黄。多子白、反修２号、沙杂１５号、丰收白、波友３号等品种也比较抗病。
2、２、建立无病留种地，选用无病种薯和种薯锟侯希哇处理：在两季栽培地区，秋播番茄发病轻，而且秋薯生活力旺盛，种性强，适于作无病留种田种薯。在一季作区，无病留种田应与大田相距２.５公里以上，以减少病原菌传播侵染机会，并严格施行各种防治措施。选用无病种薯也是防病的有效措施，可在发病较轻的地块选择无病植株单收、单藏，留作种用。对种薯处理，可将种薯先放入４０－５０℃温水中预浸１分钟，后浸入６０℃温水中处理１５分钟，种薯和水量的比例为１:４，让水温自然下降，但不能低于５０℃。药剂处理可用500倍青枯立克液浸种５分钟，而后堆积覆盖严密，闷种２小时，再摊开晾干。
3、生物防治（用中药制剂进行番茄疫病的预防与治疗）：预防方案：绿色纯植物源药剂奥力克霜贝尔，按500倍液稀释喷雾。治疗方案：霜贝尔 50ml+ 大蒜油 15-20ml，兑水30斤进行均匀喷雾，3-5天1次，连打2-3次；打住后，转为预防。
