一、侧重上的区别：
1、mix together：多用于物，将物品混合。
2、mix up：多用于人，使人迷惑，使人弄不清楚之意。
二、用法上的区别：
1、mix together：放在句末，Part of the plan was that the town should not fall into industrial and residential zones, but mix the two parts together.
计划的一部分是这座城市不应该划分为工业区和居住区，而应把2个部分融合在一起。
2、mix up：放在中间，Jimmymixes up purple with blue.吉米把紫色和蓝色搅混了。
三、意思上的区别
1、mix together：是把两者掺和在一起，还能分清比如说牛奶里掺酱油，这还能分辨出来。
2、mix up：是混合在一起，有鱼目混珠之意，一般来说，人分不清，所以有个引申义就是。
