1、癌变。恶性肿瘤是湿疣最严重的并发症。通常在HPV16、18型感染之后，若是不及时治疗，在以后很有可能就会造成阴茎癌，宫颈癌等恶性肿瘤，早期彻底治疗是预防湿疣癌变最有效的方法。
2、非生殖器部位的瘤。湿疣病发症通过直接接触或被污染物品的间接接触，通常就会造成眼结膜的瘤和口腔粘膜的瘤。
3、传染婴儿、影响生育质量。患育生殖道疣的孕妇，湿疣病发症在分娩的时候，通过产道的婴儿就有可能被传染，而诱发婴幼儿的呼吸道疣。
4、溃疡、出血。在病变增大、增多之后，湿疣病发症往往都会引起局部的异物和不适感。因为发病的部位大多都是在包皮内、阴唇、阴道内、肛周等，这些部位很容易受微生物感染，而造成病变部位的溃疡、化脓、出血、疼痛和肿胀。
