MEGA 5.0构建进化树

1、新建一个TXT格式的文档

2、打开文档，把需要构建分子进化树的基因序列的FASTA格式序列复制粘贴到TXT文档中，并保存。

3、将文本文档的后缀“TXT”更改为“fasta”,如下图所示。

4、双击fasta文件，由MEGA5.0打开，如图

5、单击W图标中的“Align DNA”,会提醒你选择序列，单击确定即可，如下图

6、比对后的序列如下图。

7、然后我们需要把“*”号之外的序列全部删除，只留下"*"标注的序列，保存一下

8、关闭小窗口，回到MEGA5.0的主界面，单击“phylogeny”的下拉符合，选择“Construct/Test Neighbor-Joining Tree...“，选择刚才保存的文档。

9、打开之后按照默认参数点击确定即可运行，最后得到进化树如图所示。