10xGenomics单细胞转录组亚群细分策略

 时间:2026-04-22 12:41:40

1、10xGenomics单细胞转录组亚群细分策略 目前较为常见的方法有两种策略:

(1)调整亚群分辨率  

(2)亚群细胞提取出来,重新从头进行聚类

2、(1)调整亚群分辨率

      其实调整亚群聚类分辨率来实现亚群细分,官方Guided Clustering Tutorial手册有相关说明。

3、(2)亚群细胞提取出来,重新从头进行聚类

     这种方式就是要根据表达矩阵和聚类文件,把某一个聚类的所有细胞表达矩阵提取出来,然后重头分析一遍,提取表达矩阵需要两个文件:

细胞以及对应聚类编号csv文件:一共两列,第一列为细胞barcode,第二列为聚类编号。

     具体提取脚本,会有另外文章说明,这里不再概述。

     提取表达量文件后,重新按照pipeline进行分析,得到聚类结果等。

  • 营销数据分析方法
  • 淘宝怎么增加客服
  • qq至尊保在哪里抢 qq怎么获得至尊保名额
  • 小儿鞘膜积液有哪些表现?
  • 厂房通风天窗的安装要求有哪些
  • 热门搜索
    微信拍一拍功能在哪里 u盘无法识别如何修复 反恐精英怎么玩 如何借钱 做包子面粉怎么发酵 资金申请报告怎么写 普联路由器 美味英文怎么说 新闻怎么写范文 如何专升本