选择压力分析方法

 时间:2024-10-13 22:54:50

1、首先,基因的进化速率受到纯化(负)选择、突变和定向(正)选择等因素控制。为了检验选择压力对虾虎鱼亚目类群mtDNA的影响。

选择压力分析方法

3、然后,基因差异性分析,对mtDNA蛋白编码基因进行基因变异位点分析。先通过Geneiousv.5.4软件,比对10种虾虎鱼亚目鱼类的蛋白编码基因,然后利用DnaSP5.0软件分析这些蛋白编码基因的变异位点与变异特征。

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5、然后,评估所有位点的最适置换进化模型,并以AIC(Akaikeinforma-tioncriterion)参数值评价所选模型的优劣。

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