1、硅化木是真正的木化石，颜色为土黄、淡黄、黄褐、红褐、灰白、灰黑等，抛光面可具玻璃光泽，不透明或微透明。从纹理上，木化石有天然的纹理和被虫咬的肌理，任何人工雕饰都是取代不了的。在现在的市场上，想要逼真地制作有天然纹理的木化石是极不容易的。这也就成为了鉴定木化石真伪的方法之一。从木质结构上，原本腐烂的木头，在经过石英置换后，保留了木头的纹理形成了天然的玉石面，变成了不朽的宝石。木化石中的玉珍珠，形容的恰是木化石木质土黄、淡黄、黄褐中带玉的颜色。
2、木化石的形成是远古的森林在自然力量作用下被大量埋入地底，木头在高压、低温、缺氧的地质环境下浸泡于二氧化硅饱和溶液中，树木中的碳元素逐渐被二氧化硅交代，并保留树木的原始形态及构造特点，纳入围岩的微量元素，形成五彩斑斓的色泽，这就是木化石的成因。这种替换作用非常精确，以至于不仅如实体现出外部形状而且还体现出内部构造，有时甚至可以确定细胞构造。
