1、由于鱼巢所用的材料基本上是来自各种水生植物，均来自天然水体中，常会带来野杂鱼的卵、鱼苗和病菌等。
2、因此，必须在用前半个月左右捞回来，经过处理,除去枯枝烂叶,清洗干净,用药物消毒，然后用清水冲洗除去药液后，方能使用。
3、处理鱼巢常用的药物和方法是:用2%的食盐水浸泡20~ 40 分钟。
4、可杀灭附在水草上的病菌和寄生虫，也可使水螅从水草上脱落。
5、对水草无害。用1毫克/升的高锰酸钾溶液,浸泡1小时左右，再用清水冲洗干净，用20 毫克/升的呋喃西林药液，浸泡1小时左右，杀菌能力很强。
6、用8 毫克/升的硫酸铜溶液，浸泡1小时左右，可杀死水螅和病菌。杨柳根和棕皮、棕丝经过消毒后，扎成小捆，再用绳系于产卵池中。
