1、一、蛋白质分离技术1.双向凝胶电泳 双向凝胶电泳是一种高分辨率的蛋白质分离技术。一般能分离到1000-3000个蛋白质点，最佳分离到11000个左右的蛋白质点。但是强酸、强酸、相对分子质量过大、过小的蛋白质难以分离，且实验的重复性差。
3、二、蛋白质鉴定技术1、质谱 质谱技术能鉴定蛋白质并准确测量肽段和蛋白质的相对分子质量、氨基酸序列及翻译后的修饰。其工作原理是通过离子化装置将分子转化为气态离子，根据不同离子间的质仔荠肓阻荷比（m/z）的差异来分离并确定相对分子质量。质谱技术能与多种蛋白分离技术联用，且准确度高。
5、三、生物信息学 生物信息学已广泛应用到现代生命科学的各个领域。目前，在蛋白质组学方面的应用主要有：构建与分析蛋白质双向凝胶电泳图谱数据库；蛋白质氨基酸序列、蛋白质结构域、蛋白质相互作用等数据库的建立和检索；蛋白质结构的预测等。
